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No anime/mangá Naruto existem classificações ninjas que expressam a experiência possuída por cada ninja. São divididos em categoria para que um ninja mais fraco não faça uma missão complicada. Para subir de classificação é necessário passar por um teste, o que sempre é difícil, que exige força, inteligência e outros atributos. As classificações são:

Sannins Fortes candidatos ao cargo de Kage, são considerados "Ninjas Lendários" e que decidiram viver fora de suas respectivas vilas por razões pessoais, porém não são considerados Ninjas-Rejeitados, pois mantém o contato com suas vilas. São pessoas de incalculável poder e muita sabedoria. A força de um Sannin chega até a ser comparada com a de um Kage.
Os Sannins que aparecem no anime são os Três Sannins Lendários de Konoha: Jiraya, Orochimaru e Tsunade, os três discípulos de Sandaime, o Terceiro Hokage.

Alunos da Academia - Assim são chamados os que estão em fase de treinamento. Ainda não podem fazer missões e geralmente são crianças. Passam por um teste feito pelo professor do curso, um chuunin, e se passarem, tornam-se genins e são divididos em varios trios, cada qual com seu instrutor jounin. Se o jounin quiser, pode fazer um teste adicional com o time que recebeu e, se considerar os alunos incapazes, pode mandá-los de volta para a academia.

Genin (下忍) - Fazem missões nível D e, no máximo, C . Geralmente não possuem técnicas avançadas. Com o tempo, seu jounin pode achar que eles estão prontos para o Exame Chuunin, um teste para virar chuunin. Ele é dividido em: teste escrito, teste de sobrevivência, e se houverem muitos participantes, uma eliminatória, finalizando com um campeonato. Nele, várias pessoas vêm do mundo inteiro para ver os ninjas, o que acaba sendo uma propaganda para os ninjas de cada vilarejo. Mesmo se a pessoa perder na primeira luta e o Hokage decidir que ele tem potencial, ele vira um chuunin, logo, o vencedor do campeonato pode não virar um chuunin, se não possuir potencial.

Chuunin (中忍) - É denominado Chuunin o ninja que passa no Exame Chuunin. Fazem missões nível C ou B, ou são levados até a Academia para virarem professores. Quando um Chuunin é muito experiente pode tornar-se um jounin ou um ANBU.

Tokubetsu Jounin (上忍下) - São Jounins especializados numa área ninja e executam missões selecionadas de acordo com suas especialidades.Essas missões não são limitadas à espionagem, tortura, assassinatos e outros similares, mas também se estendem à educação e pesquisa, com cada seleção batendo de acordo com suas habilidades e conhecimento. Os ninjas desse nível também são chamados para serem os Supervisores do Exame Chuunin.

Jounin (上忍) - Sao a elite do vilarejo e fazem missões de nivel B, A e S. Alguns treinam genins, como Kakashi e Asuma .Existem também os Jounins especiais,que exercem a função de examinadores no Exame Chuunin ou que são especialistas em treinar um certo tipo de ninja,como Ebisu,que é especialista em treinar ninjas candidatos a Hokage

ANBU - (Ansatsu Senjutsu Tokushu Butai 暗殺戦術特殊部隊) - Conjunto de ninjas que estão sob o comando direto do líder do vilarejo. Suas identidades são mantidas em segredo. Por isso, usam máscara , Sendo jounins ou chuunins. Existe ainda a ANBU Ne.

Hokage (影) - Possuem o nome de acordo com seu vilarejo (Hokage, em Konoha, Kazekage, em Suna, e assim vai). Existe somente um por vilarejo. Um ninja só pode ser nomeado para o cargo pelo conselho da vila. Administram e defendem a vila.


Nukenin (抜け忍) - Ninjas que fogem de suas vilas por diversos motivos. Alguns vão embora por não quererem mais fazer missões, outros por que outras vilas oferecem mais poder e status(caso do jounin Aoi) e ainda há aqueles que se juntam a organizações criminosas, como os Sete Espadachins da Névoa(Momochi Zabuza, Raiga...) e a Akatsuki(Uchiha Itachi, Sasori, Deidara...). Os ninjas da Akatsuki fazem um arranhão horizontal em suas bandanas (As vezes por acaso).

Oinin (追い忍) - São caçadores Ninja, também conhecidos como Ninjas rastreadores são os shinobis especializados em matar ou capturar os Ninjas-Rejeitados que fogem da vila, os Nukenins. São shinobis extremamente inteligentes e conhecedores da estrutura corporal de um ser humano e podem imobilizá-lo sem matar. Usam uma máscara para esconder a identidade. Ao encontrarem os Nukenins, os oinins os matam para que os segredos da vila não sejam revelados a inimigos. Em Konoha, quem faz esse papel é a ANBU.

Cobradores - São ninjas que vêm atrás dos pergaminhos, da Terra e do Céu, durante eventos como o Chuunin Shiken, esses ninjas roubam os pergaminhos dos Genins das provas para ganharem alguma recompensa, ou usarem em outras provas, esses ninjas são no máximo Genins com habilidades de Jounin e/ou Chuunin. Yakushi Kabuto disse que Oboro, Kagari e Mubi eram cobradores para conseguir fazer com que Uchiha Sasuke passe no Chuunin Shiken.

Ryounin - São os Ninjas Cozinheiros, suas missões são as de alimentar os outros Shinobis durante as missões de longo duramento, sua aparição se deu somente no episódio filler 168.

Ninja Mensageiro - São os ninjas mensageiros, eles não se importam com o conteúdo a ser entregue, e sim somente em entregá-lo. Eles não possuem nomes, são designados por seqüencias numerais semelhantes aos códigos postais. Tem sua aparição somente no episódio filler 177.

Kunoichi - É a denominação dada às mulheres que são ninjas.


Missões Nivel D: Missões simples de serem feitas. Normalmente são cuidar de alguma lavoura, resgatar animais desaparecidos, passear com animais. Não envolvem nenhum tipo de batalha. São entregues a recentes Genins para que eles se acostumem a seus novos companheiros. São as missões mais baratas. Custo: de 5.000 à 50.000 ryou, o valor é de acordo com a missão.

Missões Nivel C: Missões que envolvem sair do Vilarejo. Normalmente envolvem a proteção de alguém, a entrega de documentos oficiais. Ninjas com experiência são necessários, porém pela baixa probabilidade do encontro de ninjas no caminho genins talentosos podem fazê-la, ou recentes Chuunins. Custo: de 30.000 à 100.000 ryou, o valor é de acordo com à missão.

Missões Nivel B: São mais difíceis. Têm uma grande possibilidade de encontro com ninjas inimigos. Envolvem a proteção de coisas mais importantes com grande risco. São entregues a Chuunins mais talentosos, ou muito raramente para Jounins. Custo: de 80.000 à 200.000 ryou, o valor é de acordo com a missão.

Missões Nivel A: A segunda missão mais difícil. Extremamente importantes, com altíssimo risco de morte. São caras, importantes, e são feitas pelos Jounins, com raras exceções, quando o Kage do vilarejo a faz. Custo: de 150.000 à 1.000.000 ryou, o valor é de acordo com a missão.

Missões Nivel S: A missão mais difícil. São extremamente raras e possui uma porcentagem altíssima de mortes. Somente os Kages dos vilarejos, a ANBU e alguns Jounins as realizam. Custo: acima de 1.000.000 ryou, o valor é de acordo com a missão.


Obs: Pode acontecer que fatos inesperados mudem o rank de uma missão no seu decorrer, como na missão do time Kakashi no país da Onda.Que era para ser uma missão de rank C e acabou virando uma missão de rank A.